L’Académie fédérale d'administration publique (BAköV) en tant qu’organe central de formation continue de la Fédération a été créée le 28 août 1969 par un décret du ministre de l'Intérieur de l’époque, M. Ernst Brenda.
Ce décret se basait sur une décision du conseil des ministres datant du 11 juin 1969.
Au niveau organisationnel, la BAköV faisait et fait toujours partie du Ministère fédéral de l’Intérieur, de la Construction et du Territoire.
Dans un premier temps, le siège de la BAköV se trouvait à Bonn-Bad Godesberg ; dès l'été 1987 la BAköV a pu occuper un bâtiment supplémentaire situé à Boppard pour organiser des séminaires.
Depuis 1998, le siège de la BAköV est situé à Brühl dans les locaux de l’Ecole supérieure fédérale d’administration publique (Hochschule des Bundes).